Para ilmuwan mengatakan database yang dibuat dalam proyek Eropa dapat meningkatkan keamanan pangan.
Basis data metagenom makanan dikembangkan sebagai bagian dari proyek MASTER yang didanai UE. Metagenom adalah materi genom dari semua mikroorganisme di suatu lingkungan.
CuratedFoodMetagenomicData (cFMD) adalah database metagenom dari makanan. Teknologi pengurutan DNA akan membantu para peneliti mengatasi tantangan seperti limbah makanan, resistensi antimikroba, dan keamanan pangan.
Mikroba dapat berdampak positif pada produksi pangan, seperti melalui fermentasi pangan, atau berdampak negatif pada produksi pangan, seperti pembusukan atau penyakit bawaan makanan.
Analisis mikroba ini bergantung pada pendekatan tradisional yang memerlukan pertumbuhan mikroorganisme pada agar-agar dalam cawan Petri, dengan agar-agar berbeda yang digunakan untuk mikroorganisme berbeda.
Manfaat keamanan pangan
Para ilmuwan mengatakan penggunaan metode pengurutan DNA dengan throughput tinggi dapat meningkatkan pengujian makanan. Metode ini memungkinkan pengujian yang cepat dan simultan untuk semua mikroorganisme secara paralel, termasuk mikroorganisme yang sulit tumbuh.
Pekerjaan tersebut mencakup pengujian DNA terhadap ribuan sampel yang dikumpulkan dari fasilitas pemrosesan makanan Eropa. Basis data berarti bahwa data yang dihasilkan dari analisis sampel makanan berbasis pengurutan DNA dapat dianalisis dengan cepat dan akurat untuk mengidentifikasi dan mengendalikan mikroorganisme yang tidak diinginkan.
Proyek MASTER melibatkan 30 mitra dan dimulai pada Januari 2019. Proyek ini akan berlangsung selama empat tahun dan menggunakan teknologi pengurutan untuk memetakan mikrobioma di berbagai lingkungan makanan dan non-makanan.
Koordinator proyek Profesor Paul Cotter, kepala biosains pangan di Teagasc (Otoritas Pengembangan Pertanian dan Pangan Irlandia), mengatakan data mewakili 15 kategori makanan dari 52 negara.
“CFMD berisi data terkait 3.600 spesies mikroba, 290 di antaranya merupakan spesies baru. Ini gratis dan dapat digunakan secara luas untuk studi mikrobioma dan aplikasi dalam industri makanan. Misalnya mempelajari pergerakan mikroba di sepanjang rantai makanan, mempelajari penyebaran gen resistensi antimikroba, mendeteksi mikroba yang tidak diinginkan, dan menyelidiki penularan mikroba ke manusia. Ketersediaan cFMD mewakili langkah besar menuju masa depan di mana pengurutan metagenomik dapat menggantikan mikrobiologi klasik sebagai alat pelacakan mikroba rantai makanan yang lebih akurat dan lebih cepat.”
Penelitian terkait
Sebuah penelitian dipublikasikan di jurnal Cell. Penelitian ini dipimpin oleh tim dari Universitas Trento dan Universitas Naples Federico II di Italia, Teagasc dari Irlandia, Dewan Riset Nasional Spanyol dan Universitas Leon di Spanyol, MATIS dari Islandia, dan FFoQSI di Austria, serta kontributor lainnya.
Profesor Danilo Ercolini dari Departemen Ilmu Pertanian di Universitas Naples Federico II, mengatakan: “Ketersediaan kumpulan data yang sangat besar termasuk metagenom makanan dan genom mikroba makanan akan mewakili sumber daya penting bagi banyak ilmuwan makanan untuk mengeksploitasi lebih jauh kejadian tersebut. dan peran mikroba dalam makanan dan fasilitas pengolahan makanan dengan tujuan akhir untuk meningkatkan kualitas, keamanan, dan keberlanjutan pangan.”
Sebagian besar spesies yang dikenal sebagai penyebab penularan melalui makanan jarang ditemukan pada sampel makanan, namun Listeria monocytogenes terdeteksi satu kali, dan Clostridium perfringens terdeteksi tiga kali.
Para peneliti mendeteksi ratusan spesies yang tidak memiliki ciri khas dalam mikrobioma makanan.
“Isolasi yang ditargetkan dan karakterisasi fungsional mikroba makanan yang kami deteksi hanya melalui metagenomik harus menjadi langkah berikutnya untuk memanfaatkan lebih jauh peran mereka dalam pemrosesan, kualitas, dan keamanan pangan. Temuan kami mendukung pengetikan molekuler, yang berarti mengembangkan sertifikasi keaslian dan asal makanan berdasarkan spesifisitas mikroba,” kata mereka.
(Untuk mendaftar berlangganan gratis Berita Keamanan Pangan, klik di sini.)
